Prof. Dr. Marcus Koch
Forschungsgebiete:
Evolutionsbiologie der Pflanzen
Biodiversitätsforschung
Verwandtschaftsforschung bei Pflanzen (Systematik, Phylogenie und Taxonomie)
Natur- und Artenschutz in einem landschaftsbezogenen Kontext
Molekulare Evolution und Genomik
Artbildungs- und Adaptationsprozesse
Entwicklung sammlungsbasierter Konzepte für die Forschung
Lebenslauf
- 10/1987-06/1992 Study of Biology, University of Osnabrück (Diploma)
- 1992-1995 PhD, Institut für Botanik, University of Osnabrück (summa cum laude, Prof. Dr. Herbert Hurka)
- 01/1996-02/1998 Postdoctoral Research Associate, MPI for Plant Breeding Cologne
- 03/1998-03/1999 Postdoctoral Research Associate, MPI for Chemical ecology Jena (Thomas Mitchell-Olds)
- 03/1999-02/2002 Independent research group leader, University of Applied Life Sciences, Vienna
- 03/2002 Venia Docendi (Habilitation), University of Applied Life Sciences, Vienna
- 10/2002-03/2003 aoProfessor (permanent), University of Applied Life Sciences, Vienna
- 4/2003 onwards
- Professor for Plant Sytematics, Biodiversity and Evolution, University of Heidelberg, Germany
- Director of the Herbarium and Botanical Gardens (HEID)
- Head Biodiversity Research Center Heidelberg
- 2005-2007 Managing Director, Heidelberg –Institute of Plant Sciences
- 2009 onwards Spokesman “Young University” Heidelberg
- 2010 onwards
- Founding Director and Vice executing director Heidelberg Center for the Environment (HCE)
- 2020: Managing director
- Since 2021: board of directors
- 2016 Appointment as permanent and full guest professor at Praque University
- 2019 Appointment guest professor at UC Santiago (Chile)
- 2016-2019 Managing Director Centre for Organismal Studies (COS)
Arbeitsvorhaben
Dangerous and Endangered Landscapes – Perspectives and Consequences
Langsam ablaufende Prozesse (slow onset events) im Kontext des Klimawandels, der Umweltzerstörung, des Biodiversitätsverlustes und weiteren krisenhaften Mensch-Umwelt-Interaktionen stellen globale politische und gesellschaftliche Herausforderungen dar. Diese Prozesse werden regelmäßig durch einzelne Katastrophenereignisse unterschiedlicher Häufigkeit und Größenordnung überlagert. Erforderlich sind daher integrative Analysen von Umweltdynamiken und Landnutzungspraktiken, wobei entsprechende Anpassungsstrategien im Lichte politischer Erwägungen entwickelt und umgesetzt werden müssen. Als gemeinsamen Ausgangspunkt wählen wir das Konzept der Landschaft, das seit den universalistischen Vorstellungen Alexander von Humboldts zahlreichen Paradigmenwechseln unterlegen hat. Unter Berücksichtigung unterschiedlicher konzeptioneller und methodischer Zugänge aus unseren jeweiligen Disziplinen möchten wir die Konnektivität und Rückkopplungen zwischen gefährdeten und gefährlichen Landschaften als produktives Spannungsfeld für neue Forschungswege ausloten. Neben der Analyse von Governance-Arrangements sollen das Verständnis von langsam voranschreitenden Prozessen in fragilen Umwelten verbessert und die Rolle von Wissen im Rahmen der Governance untersucht werden. Das Vorhaben ist so konzipiert, dass die bestehenden Forschungsprofile der beteiligten Forscherinnen und Forscher zur Geltung kommen, diese jedoch disziplinär und interdisziplinär weiterentwickelt werden können. Zudem besitzt das Projekt ein hohes Transferpotenzial, da internationale Organisationen ausdrücklich dazu aufgerufen haben, die hier untersuchten Prozesse besser zu verstehen und Handlungsempfehlungen zu formulieren.
Ausgewählte Publikationen:
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Walden N., German D.A., Wolf E.M., Kiefer M., Rigault P., Huang X-C., Kiefer C., Schmickl R., Franzke A., Neuffer B., Mummenhoff K., Koch M.A. (2020) Nested whole-genome duplications coincide with diversification and high morphological disparity in Brassicaceae. Nature Communications 11,3795, doi: 10.1038/s41467-020-17605-7.
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One Thousand Plant Transcriptomes Initiative (2019) One thousand plant transcriptomes and the phylogenomics of green plants. Nature 574: 679-685.
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Wolf E., Gaquerel E., Scharmann M., Yant L., Koch M.A. (2021) Evolutionary footprints of a cold relic in a rapidly warming world. eLIFE, 10.7554/eLife.71572.
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Kiefer C., Willing E.-M., Jiao W.B., Sun H., Piednoel M., Hümann U., Hartwig B., Koch M.A., Schneeberger K. (2019) Inter-species association mapping links reduced CG-TG substitution rates to the loss of gene body methylation. Nature Plants, https://doi.org/10.1038/s41477-019-0486-9
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Novikova P., Hohmann N., Nizhynska V., Lanz C., Tsuchimatsu T., Muir G., Guggisberg A., Paape T., Schmid K., Fedorenko O., Holm S., Säll T., Schlötterer C., Marhold K., Widmer A., Sese J., Shimizu K.K., Weigel D., Krämer U., Koch M.A., Nordborg M. (2016) Sequencing of the genus Arabidopsis reveals a complex history of non-bifurcating speciation and abundant trans-specific polymorphisms. Nature Genetics. doi:10.1038/ng.3617.
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Mable B.K., Brysting A.K., Jørgensen M.H., Carbonell A.K.Z., Kiefer C., Ruiz-Duarte P., Lagesen K., Koch M.A. (2018) Adding complexity to complexity: gene family evolution in polyploids. Frontiers in Ecology and Evolution.
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Hohmann N., Koch M.A. (2017) An Arabidopsis introgression zone studied at high spatio-temporal resolution: interglacial and multiple genetic contact exemplified using whole nuclear and plastid genomes. BMC Genomics. DOI: 10.1186/s12864-017-4220-6.
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Mandáková T., Hloušková P., Koch M.A., Lysak M.A. (2020) Genome Evolution in Arabideae was Marked by Frequent Centromere Repositioning. The Plant Cell (DOI: https://doi.org/10.1105/tpc.19.00557)
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Guggisberg A., Liu X., Suter L., Mansion G., Fischer M.C., Fior S., Roumet M., Kretzschmar R., Koch M.A., Widmer A. (2018) The genomic basis of adaptation to calcareous and siliceous soils in Arabidopsis lyrata. Molecular Ecology. doi.org/10.1111/mec.14930.
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Lopez L., Wolf E., Pires C., Edger P., Koch M.A. (2017) Molecular resources for evolutionary studies in the Brassicaceae family using transcriptomes. Frontiers in Plant Science 8:1488. doi: 10.3389/fpls.2017. 01488.
